Le hameau du Désert en Valjouffrey possède une chapelle de grandes dimensions attestée depuis 1672, à l'écart de l'église paroissiale.
La Chapelle Sainte-Anne de Valjouffrey a longtemps bénéficié du statut de vicaire foraine, ce qui lui permettait d'avoir un prêtre desservant à demeure et pouvant procéder à tous les sacrements d'un curé titulaire (à l'exception du mariage). Elle présente en façade un grand clocher mur et un porche (déjà décrit en 1784), tous deux visiblement remaniés. Elle ouvre sur une nef allongée, voûtée en berceau. Une table de communion sépare les fidèles de l'espace sacré, surmonté d'une voûte d'arêtes. C'est la seule chapelle du territoire à posséder une sacristie (pièce voûtée d'arêtes, située derrière le chevet). Le mobilier et les ornements attestent encore de son rang particulier : elle est pourvue d'une tribune accolée au mur d'entrée, d'une chaise à prêcher et d'un confessionnal. Aujourd'hui, bien que peu mise en valeur extérieurement (auvent couvert en fibres-ciment, toiture en bac acier, au lieu des anciennes ardoises) et bien qu'elle souffre de désordres de structure (tirants métalliques fixés entre les murs), son aspect intérieur paraît inchangé et témoigne de l'histoire et de la dévotion si puissantes des communautés montagnardes de ce territoire.
